Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A13Q9NSD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A13Q9NSD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A13Q9NSD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A13Q9NSD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms