Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARHGAP35Q9NRY4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ARHGAP35Q9NRY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ARHGAP35Q9NRY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGAP35Q9NRY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGAP35Q9NRY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGAP35Q9NRY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGAP35Q9NRY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGAP35Q9NRY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
ARHGAP35Q9NRY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARHGAP35Q9NRY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGAP35Q9NRY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms