Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220.74■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 417.53■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.321e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.511e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-206ENST00000502972 1916 ntTSL 29.02□□□□□ -0.971e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.361e-11■■■■□ 21.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-208ENST00000491703 2839 ntTSL 212.84□□□□□ -0.357e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-205ENST00000431254 583 ntTSL 210.8□□□□□ -0.687e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.77e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-204ENST00000429064 442 ntTSL 36.34□□□□□ -1.397e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-202ENST00000417181 462 ntTSL 35.51□□□□□ -1.537e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5O-203ENST00000418933 415 ntTSL 55.51□□□□□ -1.537e-9■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT1-210ENST00000580380 411 ntTSL 515.86■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 JPT1-212ENST00000584079 382 ntTSL 59.44□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 21.4
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.034e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.294e-16■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-11■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-11■■■■□ 21.3
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.283e-9■■■■□ 21.2
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 516.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 213.11□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.58□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 28.33□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 318.7■□□□□ 0.583e-16■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.653e-16■■■■□ 21.1
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 39.52□□□□□ -0.893e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.863e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.013e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.68□□□□□ -0.862e-9■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.888e-7■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 21
APOBEC3CQ9NRW3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 20.9
APOBEC3CQ9NRW3 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.97e-7■■■■□ 20.9
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 521.42■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 514.28□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.386e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 C17orf99-203ENST00000586029 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.49□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.136e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 C17orf99-202ENST00000451352 2404 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-202ENST00000435087 822 ntTSL 313.94□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 C17orf99-204ENST00000586246 371 ntTSL 513.62□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-206ENST00000471326 1170 ntTSL 211.3□□□□□ -0.66e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPD1-203ENST00000579618 320 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.646e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-203ENST00000447768 842 ntTSL 510.95□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-210ENST00000531435 1284 ntTSL 210.92□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-205ENST00000459914 726 ntTSL 59.87□□□□□ -0.836e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-209ENST00000492550 733 ntTSL 59.73□□□□□ -0.856e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.576e-6■■■■□ 20.7
APOBEC3CQ9NRW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.541e-8■■■■□ 20.6
APOBEC3CQ9NRW3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-8■■■■□ 20.6
APOBEC3CQ9NRW3 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-8■■■■□ 20.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 20.6
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 320.03■□□□□ 0.88e-8■■■■□ 20.6
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 219.73■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.881e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.91e-6■■■■□ 20.5
APOBEC3CQ9NRW3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.464e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 320.23■□□□□ 0.838e-12■■■■□ 20.4
APOBEC3CQ9NRW3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.378e-12■■■■□ 20.4
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 22.8 ms