Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR39U1Q9NRG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR39U1Q9NRG7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDR39U1Q9NRG7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR39U1Q9NRG7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR39U1Q9NRG7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.3 ms