Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACSS2Q9NR19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSS2Q9NR19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSS2Q9NR19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACSS2Q9NR19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACSS2Q9NR19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACSS2Q9NR19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms