Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM5Q9NQX1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM5Q9NQX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRDM5Q9NQX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM5Q9NQX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM5Q9NQX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM5Q9NQX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PRDM5Q9NQX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM5Q9NQX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM5Q9NQX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms