Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM6Q9NQX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM6Q9NQX0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM6Q9NQX0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM6Q9NQX0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM6Q9NQX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PRDM6Q9NQX0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM6Q9NQX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms