Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKIP1Q9NQ31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AKIP1Q9NQ31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AKIP1Q9NQ31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AKIP1Q9NQ31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AKIP1Q9NQ31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKIP1Q9NQ31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms