Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHST11Q9NPF2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHST11Q9NPF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST11Q9NPF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms