Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP25Q9NPA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP25Q9NPA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP25Q9NPA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP25Q9NPA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms