Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Txnrd1Q9JMH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Txnrd1Q9JMH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Txnrd1Q9JMH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Txnrd1Q9JMH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Txnrd1Q9JMH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Txnrd1Q9JMH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Txnrd1Q9JMH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Txnrd1Q9JMH6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Txnrd1Q9JMH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Txnrd1Q9JMH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Txnrd1Q9JMH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Txnrd1Q9JMH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Txnrd1Q9JMH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Txnrd1Q9JMH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Txnrd1Q9JMH6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Txnrd1Q9JMH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms