Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rabgef1Q9JM13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabgef1Q9JM13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabgef1Q9JM13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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