Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul3Q9JLV5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul3Q9JLV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul3Q9JLV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul3Q9JLV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul3Q9JLV5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul3Q9JLV5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms