Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Col5a3Q9JLI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col5a3Q9JLI2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col5a3Q9JLI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Col5a3Q9JLI2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col5a3Q9JLI2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Col5a3Q9JLI2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col5a3Q9JLI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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