Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nectin3Q9JLB9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nectin3Q9JLB9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nectin3Q9JLB9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin3Q9JLB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nectin3Q9JLB9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin3Q9JLB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms