Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc5a3Q9JKZ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc5a3Q9JKZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc5a3Q9JKZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a3Q9JKZ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a3Q9JKZ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a3Q9JKZ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms