Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AatfQ9JKX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AatfQ9JKX4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AatfQ9JKX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AatfQ9JKX4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AatfQ9JKX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms