Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole3Q9JKP7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pole3Q9JKP7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pole3Q9JKP7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pole3Q9JKP7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pole3Q9JKP7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms