Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AtrQ9JKK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
AtrQ9JKK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AtrQ9JKK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AtrQ9JKK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AtrQ9JKK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms