Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rcan3Q9JKK0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rcan3Q9JKK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rcan3Q9JKK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rcan3Q9JKK0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rcan3Q9JKK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcan3Q9JKK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms