Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cacna1fQ9JIS7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna1fQ9JIS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cacna1fQ9JIS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna1fQ9JIS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacna1fQ9JIS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms