Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccl28Q9JIL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl28Q9JIL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl28Q9JIL2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl28Q9JIL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl28Q9JIL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms