Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MkksQ9JI70 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MkksQ9JI70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MkksQ9JI70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MkksQ9JI70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MkksQ9JI70 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MkksQ9JI70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms