Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI33

Ntn4, Netrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn4Q9JI33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ntn4Q9JI33 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ntn4Q9JI33 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntn4Q9JI33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntn4Q9JI33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ntn4Q9JI33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntn4Q9JI33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntn4Q9JI33 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntn4Q9JI33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntn4Q9JI33 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms