Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1AQ9HD42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP1AQ9HD42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP1AQ9HD42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP1AQ9HD42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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