Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRA1Q9HD15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRA1Q9HD15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRA1Q9HD15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRA1Q9HD15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms