Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BRMS1Q9HCU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRMS1Q9HCU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRMS1Q9HCU9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRMS1Q9HCU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRMS1Q9HCU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRMS1Q9HCU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRMS1Q9HCU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms