Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L5Q9HCM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L5Q9HCM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPB41L5Q9HCM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPB41L5Q9HCM4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EPB41L5Q9HCM4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.4 ms