Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549Q9HCM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549Q9HCM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549Q9HCM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms