Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP29Q9HBJ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP29Q9HBJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP29Q9HBJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP29Q9HBJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP29Q9HBJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP29Q9HBJ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms