Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NTN4Q9HB63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NTN4Q9HB63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTN4Q9HB63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NTN4Q9HB63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTN4Q9HB63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms