Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RANBP3Q9H6Z4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RANBP3Q9H6Z4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANBP3Q9H6Z4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP3Q9H6Z4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP3Q9H6Z4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms