Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR55Q9H6Y2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR55Q9H6Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR55Q9H6Y2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR55Q9H6Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR55Q9H6Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms