Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLMPQ9H6B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLMPQ9H6B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLMPQ9H6B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLMPQ9H6B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLMPQ9H6B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms