Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX3Q9H6A9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX3Q9H6A9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCNX3Q9H6A9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCNX3Q9H6A9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms