Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RSPH9Q9H1X1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RSPH9Q9H1X1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RSPH9Q9H1X1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RSPH9Q9H1X1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RSPH9Q9H1X1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms