Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC8Q9H0W5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC8Q9H0W5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC8Q9H0W5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC8Q9H0W5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC8Q9H0W5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC8Q9H0W5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC8Q9H0W5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC8Q9H0W5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC8Q9H0W5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC8Q9H0W5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms