Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM49AQ9H0Q0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM49AQ9H0Q0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAM49AQ9H0Q0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM49AQ9H0Q0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM49AQ9H0Q0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM49AQ9H0Q0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM49AQ9H0Q0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms