Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC113Q9H0I3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC113Q9H0I3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC113Q9H0I3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC113Q9H0I3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC113Q9H0I3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC113Q9H0I3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms