Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NYXQ9GZU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NYXQ9GZU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NYXQ9GZU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NYXQ9GZU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NYXQ9GZU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NYXQ9GZU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NYXQ9GZU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NYXQ9GZU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NYXQ9GZU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms