Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MCOLN1Q9GZU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MCOLN1Q9GZU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MCOLN1Q9GZU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MCOLN1Q9GZU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MCOLN1Q9GZU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MCOLN1Q9GZU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms