Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP6Q9GZR1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP6Q9GZR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP6Q9GZR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP6Q9GZR1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP6Q9GZR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SENP6Q9GZR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SENP6Q9GZR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms