Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF3Q9GZM5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YIPF3Q9GZM5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF3Q9GZM5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF3Q9GZM5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF3Q9GZM5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms