Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn19Q9ET38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn19Q9ET38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn19Q9ET38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn19Q9ET38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn19Q9ET38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn19Q9ET38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn19Q9ET38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn19Q9ET38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn19Q9ET38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms