Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn10Q9ESK3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Capn10Q9ESK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Capn10Q9ESK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Capn10Q9ESK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Capn10Q9ESK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Capn10Q9ESK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn10Q9ESK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms