Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tfip11Q9ERA6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfip11Q9ERA6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tfip11Q9ERA6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tfip11Q9ERA6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tfip11Q9ERA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tfip11Q9ERA6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tfip11Q9ERA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfip11Q9ERA6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms