Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall1Q9ER74 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sall1Q9ER74 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sall1Q9ER74 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sall1Q9ER74 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall1Q9ER74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sall1Q9ER74 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall1Q9ER74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall1Q9ER74 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms