Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
March8Q9DBD2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
March8Q9DBD2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March8Q9DBD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
March8Q9DBD2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
March8Q9DBD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
March8Q9DBD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
March8Q9DBD2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms