Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB75

Cdip1, Cell death-inducing p53-target protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdip1Q9DB75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdip1Q9DB75 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdip1Q9DB75 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdip1Q9DB75 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms