Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cab39lQ9DB16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39lQ9DB16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cab39lQ9DB16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cab39lQ9DB16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cab39lQ9DB16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cab39lQ9DB16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cab39lQ9DB16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms